A Junta de Educação Teológica (JET) é responsável por supervisionar e administrar qualquer movimentação na área de ensino teológico e religioso da IPB e ainda, criar, colocar em funcionamento e supervisionar cursos de extensão acadêmica, mestrado e doutorado teológico e integrá-los a um dos seminários da IPB.

A JET é dividida entre as regiões do Brasil através das Juntas Regionais de Educação Teológica (JURETs), sendo essas subordinadas e intimamente ligadas à JET, que recebe seus relatórios anuais para que sejam tomadas medidas necessárias para o aprimoramento do ensino em cada região, e também as propostas de mudanças que serão levadas pela JET à Comissão Executiva da IPB.

Além de todas essas funções, a Junta de Ensino Teológico tem como responsabilidade o curso de Educação Teológica Continuada, oferecido para ministros, com a finalidade de atualização teológica; o Instituto de Pastores, que conta com a colaboração dos seminários; a nomeação de novos professores, e o intercâmbio dos professores de seminários e extensões.

Dirigentes:
Presidente: Presb. Eli dos Santos Medeiros
Vice Pres.: Presb. Francisco Solano Portela Neto
Secretário: Rev. Wilson do Amaral Filho
Tesoureiro: Rev. Jaime Marcelino de Jesus